ولد الشیخ الدكتور سيد باشا آغا عام 1979 في مدینة كويتا الباكستانية في عائلة متعلمة ومثقفة في منزل سيد مولانا عبد الأحد، تلقى تعليمه المبكر من والده الكريم وتخرج من وفاق المدارس العربية في باكستان عام 2005م بشهادة  في الدراسات الإسلامية والعربية، إلى جانب الدراسات الدينية ارتبط الشیخ الدكتور سيد باشا آغا  أيضًا بالعلوم العلمية الحديثة، فبعد حصوله على درجة البكالوريوس فی العلوم العلمية الحدیثة حصل على شهادة ماجستير في الدراسات الإسلامية عام 2002 م ثم على ماجستير في الفلسفة عام 2008م وعلى درجة الدكتوراه في الدراسات الإسلامية والعربية من جامعة بلوشستان عام 2014م، ثم أكمل  درجة ما بعد الدكتوراه من الجامعة الإسلامية الدولية إسلام أباد عام 2020م.

يعمل حاليًا أستاذًا مساعدًا في الكلية الحكومية للدراسات العليا في مدينة كويتا ورئيس قسم الدراسات الإسلامية والعربية هناك، تم نشر أكثر من 50 ورقة بحثية في مختلف المجلات الوطنية والدولية العلمية المحكمة، وشارك في أكثر من 25 مؤتمرًا دوليًا وقدم أوراقًا بحثیا، كما يعمل الشیخ الدكتور سيد باشا آغا كرئيس ومحرر مجلة “راحت  القلوب” وهي مجلة بحثية علمية محكمة ومعتمدة من هيئة التعليم العالي الباكستانية.